LightGBM
今回は PFN が公開している OSS の xfeat を使った特徴量エンジニアリングについて見ていく。 xfeat には次のような特徴がある。 多くの機能が scikit-learn の Transformer 互換の API で提供されている 多くの機能が CuPy / CuDF に対応しているため CUDA …
これを書いている現在 (2021-11)、Apple Silicon 版の Mac を使って Python の開発環境を整えようとすると、なかなかしんどい。 しんどさの主な要因は、サードパーティ製のパッケージが Apple Silicon をまだサポートしていない場合が多い点にある。 たとえ…
XGBoost は同じデータセットとパラメータを用いた場合、学習に使うデータの量 (行数) と最適なイテレーション数が線形な関係にあることが経験的に知られている 1。 今回は、それが同じ GBDT (Gradient Boosting Decision Tree) の一手法である LightGBM にも…
今回は、LightGBM が構築するブースターに含まれる決定木を可視化した上で、その分岐を追いかけてみよう。 その過程を通して、LightGBM の最終的な出力がどのように得られているのかを確認してみよう。 使った環境は次のとおり。 $ sw_vers ProductName: mac…
以前、このブログでは機械学習モデルの解釈可能性を向上させる手法として SHAP を扱った。 blog.amedama.jp 上記のエントリでは、LightGBM の train() 関数と共に、モデルの学習に使ったデータを解釈していた。 今度は cv() 関数を使って、Out-of-Fold なデ…
今回は、機械学習モデルの解釈可能性を向上させる手法のひとつである LIME (Local Interpretable Model Explanations) を LightGBM と共に使ってみる。 LIME は、大局的には非線形なモデルを、局所的に線形なモデルを使って近似することで、予測の解釈を試み…
MLflow は MLOps に関連した OSS のひとつ。 いくつかのコンポーネントに分かれていて、それぞれを必要に応じて独立して使うことができる。 その中でも、今回扱う MLflow Models は主に学習済みモデルやパイプラインの取り回しに関するコンポーネント。 MLfl…
今回は LightGBM の cv() 関数から得られる複数の学習済み Booster から特徴量の重要度を取り出して可視化してみる。 それぞれの Booster 毎のバラつきなどから各特徴量の傾向などが確認できるかもしれない。 使った環境は次のとおり。 $ sw_vers ProductNam…
SHAP は協力ゲーム理論にもとづいて機械学習モデルを解釈する手法と、その実装を指している。 今回は、あまり理論の部分には踏み込むことなく、使い方を中心として書いていく。 使った環境は次のとおり。 $ sw_vers ProductName: Mac OS X ProductVersion: 1…
今回は LightGBM の cv() 関数について書いてみる。 LightGBM の cv() 関数は、一般的にはモデルの性能を評価する交差検証に使われる。 一方で、この関数から取り出した学習済みモデルを推論にまで使うユーザもいる。 今回は、その理由やメリットとデメリッ…
今回は特徴量選択 (Feature Selection) の手法のひとつとして使われることのある Null Importance を試してみる。 Null Importance というのは、目的変数をシャッフルして意味がなくなった状態で学習させたモデルから得られる特徴量の重要度を指す。 では、…
最近 LightGBM にコントリビューションする機会を得たので、その際に調べたことの備忘録を残しておく。 現時点では、Python 周りの開発環境についてドキュメントは特に見当たらないようだった。 以下は CI 環境のスクリプトやエラーメッセージを読みながら雰…
MLflow は MLOps に関連した OSS のひとつ。 いくつかのコンポーネントに分かれていて、それぞれを必要に応じて独立して使うことができる。 今回は、その中でも実験の管理と可視化を司る MLflow Tracking を試してみることにした。 機械学習のプロジェクトで…
Optuna v1.5.0 では、LightGBM インテグレーションの一環として LightGBMTunerCV という API が追加された。 これは LightGBM の cv() 関数を Step-wise algorithm で最適化するラッパーになっている。 つまり、重要ないくつかのパラメータを Step-wise で調…
最近、Twitter のタイムラインで QWK (Quadratic Weighted Kappa: 二次の重み付きカッパ係数) の最適化が話題になっていたので個人的に調べていた。 QWK は順序つきの多値分類問題を評価するための指標で、予測を大きく外すほど大きなペナルティが与えられる…
先日の PyData.tokyo で発表されていた Optuna の LightGBMTuner だけど v0.18.0 でリリースされたらしい。 まだ Experimental (実験的) リリースでドキュメントも整備されていないけど、動くみたいなのでコードを眺めながら試してみた。 github.com LightGB…
ニューラルネットワークを実装するためのフレームワークの Keras は LightGBM と似たようなコールバックの機構を備えている。 そして、いくつか標準で用意されているコールバックがある。 keras.io そんな中に ModelCheckpoint というコールバックがあって、…
クラス間の要素数に偏りのある不均衡なデータに対する分類問題のアプローチとして、多いクラスのデータを減らすアンダーサンプリングという手法がある。 データをアンダーサンプリングしてモデルに学習させることで、評価指標が改善したりモデルの学習時間を…
不均衡データに対する分類問題のアプローチとして、多いクラスのデータを取り除く Under-sampling という手法がある。 さらに、複数の Under-sampling したデータを用いて、複数のモデルを用意する Bagging という手法を組み合わせることがある。 今回は、そ…
今回は、前回のエントリを書くきっかけになったネタについて。 blog.amedama.jp 上記は今回扱う LightGBM の cv() 関数から取得した _CVBooster のインスタンスで起きた問題だった。 このインスタンスは、そのままでは pickle で直列化・非直列化 (SerDe) で…
LightGBM の学習率は基本的に低い方が最終的に得られるモデルの汎化性能が高くなることが経験則として知られている。 しかしながら、学習率が低いとモデルの学習に多くのラウンド数、つまり計算量を必要とする。 そこで、今回は学習率を学習の過程において動…
今回は LightGBM の Python パッケージを Git のソースコードからインストールする方法について。 まだリリースされていない最新の機能を使いたい、あるいは自分で改造したパッケージを使いたい、といった場合に。 なお、インストール方法は以下に記載されて…
LightGBM の学習が進む様子は、学習させるときにオプションとして verbose_eval などを指定することでコンソールから確認できる。 ただ、もっと視覚的にリアルタイムで確認したいなーと思ったので、今回はコールバックと Matplotlib を使って学習曲線を動的…
今回は LightGBM で、組み込みで用意されていない独自の評価指標 (カスタムメトリック) を扱う方法について。 ユースケースとしては、学習自体は別の評価指標を使って進めつつ、本来の目標としている評価指標を同時に確認するといったもの。 例えば、精度 (A…
(2020-09-05 追記) LightGBM v3.0.0 から cv() 関数に return_cvbooster オプションが追加されました。 これにより直接 CVBooster のインスタンスが取得できるため、下記のコールバックを使う必要はなくなりました。 勾配ブースティング決定木を扱うフレーム…
以前このブログで LightGBM を使ってみる記事を書いた。 ただ、この記事で使っている Iris データセットにはカテゴリ変数が含まれていなかった。 blog.amedama.jp そこで、今回はマッシュルームデータセットを使ってカテゴリ変数が含まれる場合を試してみる…
